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SIATER说 | 周丰丰:坚持做自己喜欢的事情

时间:2022-01-04  来源:文宣办 文本大小:【 |  | 】  【打印

  国庆前夕,周丰丰接受小钜远程采访时,感激地说:“2021年是我回国的第十个年头,我于2011年离开美国回国发展,受聘于深圳先进院医工所,在这里得到了综合能力的全面锻炼。2015年,我来到吉林大学工作,从零起步组建研究团队,获得‘唐敖庆特聘教授’称号,之所以能够在吉林大学取得较为突出的成绩,这与我之前在先进院获得的锻炼分不开。我一直在坚持做自己喜欢的事情,而且乐此不疲。”

  赴美求学切入生物医学

  2005年7月,周丰丰获得中国科学技术大学计算机软件与理论专业博士学位,师从中科院院士陈国良院士。

  同年9月,他远赴美国,开始了生物信息学的深造。在美国乔治亚大学生物信息研究所所长徐鹰教授的实验室担任生物信息学博士后,从事比较基因组学方面的研究。

  周丰丰回忆道:“我在美国主要是做微生物与高等生物基因交互的研究,微生物的几个基因连成了一个基因岛,基于基因岛的原理,我先用统计学做出一个指标,再用指标检测这些基因岛是否具有抗药性,或者致病性,这项研究很有意义,先后在Nature Protocols、Genetics等杂志上发表了相关的学术成果。”徜徉在生物医学的海洋,他十分享受,不知不觉,6年时光一晃而过。他分别于2008年12月和2009年1月晋升为美国乔治亚大学生物能源计算生物学研究组组长和健康信息学助理研究科学家。

  “先进院教会我带团队”

  2011年,周丰丰决定回国发展,他给国内几家科研机构投了求职简历,令他惊喜的是,深圳先进院反馈速度是最快的,不仅为远在美国的周丰丰提供了远程面试,而且很快就敲定了岗位和待遇等细节。他最终被深圳先进院聘用为医工所健康信息学研究员。

  周丰丰笑言:“深圳先进院最大的特点就是快,效率高,这对我科研习惯的养成与带队伍的习惯有很大影响,我也喜欢高效率地做事情。那个时候,在研究中心内部我与李烨、蔡云鹏等同事紧密交流,与数字所的冯圣中老师和魏彦杰等人展开合作,每天都很充实。”

  2012年,一名汕头大学访问学生郭貔加入了周丰丰团队,郭貔提出要做银屑病的数据预测,后来周丰丰带领这支年轻的团队建模、预测银屑病,后来还参加了国际疾病预测竞赛,荣获第三名,2014年整理科研成果,并在Genomics上发表了学术论文Gene Expression Profile based Classification Models of Psoriasis,受到学术界和产业界的关注。

  “先进院鼓励我们多跟企业、医院各个机构开展横向合作,我可以学习到很多的东西,后来我担任了医工所医学信息中心执行主任,”周丰丰感慨地说,“职务升高了,责任就更大了,在管理岗位上又锻炼了我的协调能力、沟通能力、组织能力,这些综合能力的提高对我日后成长大有裨益。”

  教书育人与科研工作齐头并进

  2015年,周丰丰调任吉林大学去执教。他说:“在先进院的时候,每位老师能带的研究生学生指标很少,可我希望壮大研究队伍,而当时吉林大学答应我一年可以招十位左右硕博研究生,为了有更好的团队建设条件,我就决定去吉林大学计算机科学与技术学院工作。”

  大学与科研机构不一样,教书育人是大学教师的重要职责。周丰丰为了提供给学生增强动手能力的课程,专门为加强班的学生设计了“机器学习与Pyphon”的课程,吸引了一大批多个专业的优秀本科生前来听课。学生们做出成果后还发表了很好的学术期刊论文,有力帮助了这些学生获得国内外顶级学府的深造机会。

  为了提高高中生的科学素质,周丰丰还经吉林大学推荐担任“英才计划”科研导师,选拔优秀的高中生参与科研锻炼,从小培养他们的科学素养。他指导的长春市实验中学刘建一同学获得2019年度“英才计划”计算机学科“优秀学员”称号。

  周丰丰很懂年轻学子的心理,他说:“我并不特别强调搞科研就一定要坐冷板凳,这样说只会让学生视科研为畏途,我常对学生说去做自己喜欢的事情吧,因为不喜欢就不可能坚持下去,只有做自己喜欢的事情才能坚持得长久,并可以克服暂时的困难。兴趣是最好的老师,这话一点不假。而且我相信,做自己喜欢的事情,扎扎实实地做事,待遇也不会差的,这样就更符合年轻大学生对理想生活的追求了。”

  值得关注的是,周丰丰团队在科研上也屡建奇功。去年上半年,新型冠状病毒传播速度之快给全球造成灾难性的损失。研究新型冠状病毒的流行趋势,进化情况以及对其全基因组进行分析,对认识一种新发传染病具有重要意义。在病毒爆发的早期,研究人员从全基因组入手,系统分析预测了基因组的进化趋势以及潜在的糖基化修饰,为进一步理解新型冠状病毒提供了理论基础。2020年7月31日,吉林大学王国庆、周丰丰团队在Briefings in Bioinformatics杂志上发表题为 Application of Bayesian phylogenetic inference modelling for evolutionary genetic analysis and dynamic changes in 2019-nCoV的文章,应用计算生物学与分子生物学交叉学科技术对新型冠状病毒(2019-nCoV)的基因组修饰及分子进化特征进行分析,进化分子钟显示2019-nCoV共同祖先出现的时间早于报道的第一例病例。同时,利用贝叶斯天际线估测有效种群的活跃时间,其活跃时间也早于第一例发病病例,提示2019-nCoV或早就存在。该工作系统解析了2019-nCoV的传 播方式及进化方向,对疾病的防治及预警具有重要的科学意义。

  从周丰丰排得满满的时间表上可以看出,他在先进院养成的高效率做事习惯,一直保持至今,这也让他收获了不少荣誉:相关科研成果2014年度第二届中国大数据技术创新大赛的成功参与奖、2015年度“中国好创意”全国青年大数据创新大赛的二等奖和2020年度阿里云天池大赛“AI开发者创新应用赛”创新奖。从他身上,可以看出一个人在做自己喜欢的事情的时候,有多么精进和幸福。

  人物简介

  周丰丰:“唐敖庆特聘教授”,博士生导师,IEEE(美国电气和电子工程师协会)高级会员。周丰丰博士的团队主要从事健康大数据挖掘核心算法的研究。2011年被中国科学院深圳先进技术研究院聘用为健康信息学研究员。2015年被吉林大学聘用为健康大数据教授、博导。已发表SCI索引学术论文93篇,根据SCI数据库统计,总引用次数1771次,他引次数1366次。学术成果多次在包括Nature Protocols(影响因子9.673,1篇)、Nucleic Acids Research(影响因子9.112, 3篇)、Bioinformatics(影响因子4.981,3篇)、BMC Genomics(影响因子3.986, 2篇)和Genetics(影响因子5.963,1篇)等高水平SCI索引学术期刊上发表。

 

周丰丰博士

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