科研进展--中国科学院深圳先进技术研究院

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科研进展

03-122024

Cell Reports Medicine | 李汉杰团队等构建早期肺腺癌免疫动态图谱并揭示Tfh细胞抗肿瘤机制

肺癌的发生发展是一个包括起始、侵袭、进展和转移的多步过程。肺癌细胞与免疫微环境会发生错综复杂的相互作用，伴随着免疫微环境的一系列动态变化。早期肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）及其前体包括非典型腺样增生(atypical adenomatous hyperplasia，AAH)、原位腺癌(invasive adenoc...
03-062024

Nature Communications | 丝网印刷钙钛矿CMOS面阵探测器实现高性能动态X射线成像

近日，中国科学院深圳先进技术研究院与华中师范大学合作，在权威刊物Nature Communications在线发表研究论文“Dynamic X-ray imaging with screen-printed perovskite CMOS array”。团队经过两年多的联合攻关，先后解决了钙钛矿半导体晶体生长动力学、专用低暗电流CMOS像素芯片、数据读...
03-012024

Nano Today| 靶向插入蛋白质三维结构而实现生物学功能抑制的纳米药物开发

为未来设计靶向功能生物分子的纳米候选药物提供了一种全新思路。蛋白质是生命的基础，几乎参与细胞的所有生命过程。蛋白质与其他分子的相互作用，如其他蛋白质、核酸或小分子，对于维持生命的健康状态有重要的意义。因此，参与细胞功能的蛋白是重要的药物靶点。近期研究已表明，无机纳米材料可通过与蛋白质的选择性特异作用，实现抑制蛋白质功能的作用...
03-012024

European Radiology :无需CT的全身PET智能衰减校正技术

近日，中国科学院深圳先进技术研究院劳特伯生物医学成像研究中心胡战利研究员团队与中山大学附属肿瘤医院以及上海联影医疗公司合作，研发了一种无需CT的全身PET智能衰减校正技术，有效降低了临床 PET/CT检查中多次CT扫描对于患者的辐射剂量，相关成果以“Learning CT-free attenuation-co...
02-212024

Current Opinion in Biotechnology | 基因组规模代谢模型分析单细胞组学

文章首先回顾了利用GEM处理批量样品组学数据的常用方法，然后介绍了利用GEM分析单细胞组学数据的进展，最后指出了该领域当前面临的挑战。单细胞技术的广泛应用产生了大量的单细胞数据，因此对单细胞数据分析和解释方法的需求不断增长。虽然单细胞数据可以通过机器学习等方法进行分析，但对数据的解释仍相对缺乏。基因组规模代谢模型（Genome-scale metabolic model，GEM）包含先验的代谢网络知识，已成为整合并解释批量样本组...
02-212024

Advanced Science | 自动化+机器学习攻克代谢途径改造不确定性的技术壁垒

研究团队利用自动化大设施平台技术，确定可控的进化轨迹，实现了代谢通路多个关键性基因的自动化同步进化。北京时间2月6日，中国科学院深圳先进技术研究院合成所罗小舟团队与Jay D. Keasling团队合作在Advanced Science发表题为Pathway evolution through a bottlenecking-debottlenecking strategy and machine learning-aided flux balancing的文章。这项研究旨在解决代谢途径工程中的一个关键...
02-212024

Metabolic Engineering | 开发基于蛋白质分配约束的动态流平衡分析新方法-dCAFBA

研究团队开发了一种名为受蛋白质分配约束的动态流平衡分析新方法（dCAFBA）。微生物总是生活在不断变化的环境中。为了生存，细菌建立了适应这些变化的能力。其中，代谢通量的重排和蛋白质组的重分配是细菌应对环境变化的常用策略[1-2]。比如，当外部营养条件改变时，细胞会及时调整内部代谢活动以合成氨基酸前体等关键代谢物，进而引起蛋白质组中不同种类蛋白质（例...
02-212024

Cell reports封面文章 | 串联重复的真核核糖体DNA的深度精简与重塑

本研究揭示了酵母rDNA区域组织形式的高度可塑性，是戴俊彪团队近期取得的Sc3.0计划的又一重要成果合成基因组学可以通过对基因组的设计与合成，合理引入自然界不存在的人造法则，从而创建出可调控的人工合成生命体。近年来，人们已经具备对病毒、细菌基因组的设计与合成的能力，并已经成功构建了最小原核生物基因组。同样地，真核生物基因组的合成也取得一系列进展，首个真核生物基因组...
02-212024

Nature Communications | 揭示基因流动帮助竞争性微生物群体突破物种多样性“极限”

该工作从理论上揭示了微生物群落中广泛存在的水平基因流动可以帮助竞争性微生物群体突破物种多样性“极限”，促进群落的物种多样性在环境扰动下的稳定维持。1月27日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所材料合成生物学研究中心王腾团队在国际权威学术期刊Nature Communications发表了题为Horizontal gene transfer is predicted to overcome the diversity limit of competing microbial species的研究论文。该工作从理论上揭示了微...
02-212024

Nature Communications | 构建全基因组SCRaMbLE重排酵母，加速菌株快速进化

为研究基因组结构变异对菌株环境适应性及在进化上的影响奠定了基础。基因组重排是驱动生物进化的重要力量，也是导致多种疾病如癌症等复杂性疾病的关键因素。基因组重排包括缺失、重复、插入、倒位和易位等多种形式，可通过改变基因拷贝数、扰动蛋白质编码序列以及顺式调控网络来实现。前人研究表明，基因组重排普遍存在于从原核生物到人类的所有生命系统中...

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