科研进展--中国科学院深圳先进技术研究院

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科研进展

02-212024

Metabolic Engineering | 开发基于蛋白质分配约束的动态流平衡分析新方法-dCAFBA

研究团队开发了一种名为受蛋白质分配约束的动态流平衡分析新方法（dCAFBA）。微生物总是生活在不断变化的环境中。为了生存，细菌建立了适应这些变化的能力。其中，代谢通量的重排和蛋白质组的重分配是细菌应对环境变化的常用策略[1-2]。比如，当外部营养条件改变时，细胞会及时调整内部代谢活动以合成氨基酸前体等关键代谢物，进而引起蛋白质组中不同种类蛋白质（例...
02-212024

Cell reports封面文章 | 串联重复的真核核糖体DNA的深度精简与重塑

本研究揭示了酵母rDNA区域组织形式的高度可塑性，是戴俊彪团队近期取得的Sc3.0计划的又一重要成果合成基因组学可以通过对基因组的设计与合成，合理引入自然界不存在的人造法则，从而创建出可调控的人工合成生命体。近年来，人们已经具备对病毒、细菌基因组的设计与合成的能力，并已经成功构建了最小原核生物基因组。同样地，真核生物基因组的合成也取得一系列进展，首个真核生物基因组...
02-212024

Nature Communications | 揭示基因流动帮助竞争性微生物群体突破物种多样性“极限”

该工作从理论上揭示了微生物群落中广泛存在的水平基因流动可以帮助竞争性微生物群体突破物种多样性“极限”，促进群落的物种多样性在环境扰动下的稳定维持。1月27日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所材料合成生物学研究中心王腾团队在国际权威学术期刊Nature Communications发表了题为Horizontal gene transfer is predicted to overcome the diversity limit of competing microbial species的研究论文。该工作从理论上揭示了微...
02-212024

Nature Communications | 构建全基因组SCRaMbLE重排酵母，加速菌株快速进化

为研究基因组结构变异对菌株环境适应性及在进化上的影响奠定了基础。基因组重排是驱动生物进化的重要力量，也是导致多种疾病如癌症等复杂性疾病的关键因素。基因组重排包括缺失、重复、插入、倒位和易位等多种形式，可通过改变基因拷贝数、扰动蛋白质编码序列以及顺式调控网络来实现。前人研究表明，基因组重排普遍存在于从原核生物到人类的所有生命系统中...
02-192024

Advanced Functional Materials | 深圳先进院等提出构筑高性能生物电子界面新策略

论文开发了一种简单的电化学加工技术，在常温常压下即可制备高性能MXene/PDA复合电极，为构筑新一代高性能生物电子界面提供了新策略。近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所正高级工程师张翊团队，与深圳大学彭争春教授团队合作，在Advanced Functional Materials上发表了题为Fast Electrodeposition of MXene/PDA Composites for High-Performance Bioelectronic Interfaces: An In Vitro Evaluation的研究论文。该论...
02-042024

Advanced Functional Materials |深圳先进院成功研制新型抗新冠病毒纳米材料

首次揭示了金属价态在抗新冠病毒感染中的作用，为抗病毒纳米材料设计提供了新思路。近日，中国科学院深圳先进技术研究院医药所王国成团队与李洋团队合作，在Advanced Functional Materials杂志上发表题为ZIF-67-Derived Antivirus Cobalt Hydroxide LDH Nanosheets Produced through High-Concentration Cobalt Ion-Assisted Hydration的研究论文。本研究研发了一种新型高...
02-022024

Nature | 高品质Si/Ge 半导体纤维及其柔性传感器

报道了一种基于热拉制工艺的大规模生产高质量半导体硅、锗纤维的制备技术，成功实现了硅、锗等传统脆性半导体的纤维化和柔性化北京时间2月1日凌晨，中国科学院深圳先进技术研究院材料所光子信息与能源材料研究中心杨春雷课题组的陈明研究团队与新加坡南洋理工大学魏磊教授和高华健院士团队、中国科学院苏州纳米所张其冲研究员团队合作，在Nature杂志上发表了题为High-quality Semiconductor Fibres via Mechanical ...
01-232024

Nature Protocols |下一代代谢模型构建与使用指南

文章发布了酶约束模型构建和使用的最新版工具箱GECKO 3.0，优化了旧版[1, 2]并加入了酶参数预测[3]和选择模块，使得构建任意物种的酶约束模型成为了可能。基因组规模代谢模型（Genome-scale metabolic model，GEM）是系统描述细胞代谢的数学模型，通过计算机建模开展“干”实验可以指导和部分代替费时费力或无法实现的“湿”实验，大幅提高研究效率。迄今为止，研究人员已经构建了数以千计物种的GEM，这些模型被广泛应用于生物制造和生命健康...
01-222024

IEEE TMI | CT金属伪影矫正【代码开源】

研究者提出了一种基于扩散模型先验的无监督金属伪影去除方法，扩散模型是一种具有数据分布表示能力的生成模型。近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所微创中心梁晓坤副研究员、谢耀钦研究员团队与华中科技大学合作的CT金属伪影矫正研究成果，发表在国际医学成像顶刊IEEE Transactions on Medical Imaging (IEEE TMI, IF=10.6）上。在CT扫描中，金属植入物（如牙科填充物、关节置换和外科固定器械...
01-222024

IEEE TMI | 高时间分辨CT成像

本文提出数据一致性约束的深度时间维度外插方法，利用数据一致性约束学习最优外插规则以提高时间分辨。近日，中国科学院深圳先进技术研究院医学人工智能研究中心、医学成像科学与技术系统（全国）重点实验室李印生研究员、梁栋研究员与上海联影医疗科技股份有限公司、首都医科大学附属北京天坛医院合作的高时间分辨CT成像研究成果，发表在国际医学成像顶刊IEEE Transactions on Medical Imag...

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