科研进展--中国科学院深圳先进技术研究院

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科研进展

12-132023

Nature Communications | IT+BT，罗小舟课题组揭秘酶催化常数预测的“黑科技”

研究团队提出了一种基于预训练大语言模型的统一框架UniKP，可从蛋白质序列和底物结构直接高精度预测酶的动力学参数，包括酶周转数（kcat）、米氏常数（Km）和催化效率（kcat / Km），并在考虑包括pH和温度等环境因素、高值区间预测等特定任务上实现了很好的适应。12月11日，中国科学院深圳先进技术研究院合成所罗小舟团队在Nature Communications发表题为UniKP: A unified framework for the prediction of enzyme kinetic parameters的文章。针对合成生物学和代谢工程领域湿实验测量酶动力学参数成本高、干实验算法难以准确预测等问题，研究团队提出...
12-122023

Light: science & application丨深圳先进院报道首个偏振发光0D/2D异质结纳米复合材料

团队基于构建的0D/2D无机异质结纳米复合材料，成功孕育出了偏振发光特性，并展示了发光-调光-探测于一体的多功能光学元型器件近日，中国科学院深圳先进技术研究院碳中和所丁宝福团队在Light: science & application上，以A multifunctional optoelectronic device based on 2D material with wide bandgap为题撰文，报道了首个0D/2D偏振发光异质结，为偏振发光家族增添了新成员。该工作将宽带隙二维材料的优异调光...
12-122023

Advanced Materials | 深圳先进院利用贵金属-卟啉设计坚固高效的单原子纳米酶用于鼻咽癌的靶向催化治疗

这项研究不仅提出了增强单原子纳米酶的催化活性和化学稳定性的创新策略，而且还强调了MIrP作为一种有效的纳米药物用于靶向催化肿瘤治疗的巨大潜力。近日，中国科学院深圳先进技术研究院阎锡蕴院士课题组在Advanced Materials上发表了题为Employing Noble Metal–Porphyrins to Engineer Robust and Highly Active Single-Atom Nanozymes for Targeted Catalytic Therapy in Nasopharyngeal Carcinoma的研究论文。该研究利用贵金属-卟啉...
12-082023

PNAS | 体内直接组装神经界面，实现局部和全身性免疫调节

该技术能有效地通过神经刺激调节局部和全身免疫反应，为病理性异常神经活动的治疗提供了新的视角。北京时间11月30日，中国科学院深圳先进院脑所副研究员都展宏等展示了一种不使用聚合物载体且无需手术即可直接在组织内组装神经界面的方法，其产生的神经界面可以有效连接弥散在深层筋膜骨膜中的神经末梢。该技术能有效地通过神经刺激调节局部和全身免疫反应，为病理性异常神经活动的治疗...
12-082023

Nature Catalysis | 二氧化碳衍生的低碳原料制备粮食化合物

通过代谢重构和葡萄糖抑制调控，使葡萄糖和蔗糖的产量达到每升数十克，这项研究有助于丰富基于可再生能源驱动的农业新范式。12月5日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(以下简称“合成所”)于涛课题组与Jay D. Keasling课题组合作，在Nature Catalysis发表了题为Metabolic engineering of yeast for the production of carbohydrate-derived foods and chemicals from C 1–3 molecules的研究成果...
12-062023

JACS｜深圳先进院周佳海/浙大杜艺岭组合作揭示微生物氧化偶氮类天然产物生物合成的酶学基础

研究结果显示由这两个新家族金属酶共同催化的酶促反应序列可能是细菌中不对称氧化偶氮类天然产物生成的保守策略近日，中国科学院深圳先进技术研究院周佳海课题组和浙江大学杜艺岭课题组和合作在JACS上发表了题为Conserved Enzymatic Cascade for Bacterial Azoxy Biosynthesis的研究论文。该研究揭示了微生物中氧化偶氮类天然产物关键结构基团生物合成的酶学基础，发现了一个新颖的铁离子依赖型膜结...
12-062023

Org. Lett. | 深圳先进院周佳海/古阳团队发展光促羧酸转化的新型工具酶

该研究通过对于光促脱羧酶FAP进行理性设计与定向进化改造，发展了一类新型的光促脱羧酶，实现了对于二级、三级等非天然底物的羧酸进行高效的光促脱羧转化，并应用于药物分子类似物的手性合成中。近日，中国科学院深圳先进技术研究院周佳海/古阳团队在Org. Lett.上发表了题为Enzymatic Photodecarboxylation on Secondary and Tertiary Carboxylic Acids的研究论文。该研究通过对于光促脱羧酶FAP进行理性设计与定向进化改造，发展了一类新型的光促脱羧酶，实现了对于二级、三级等非天...
12-062023

Nature Communications | Sc3.0重要进展，酿酒酵母染色体臂的精简与合成重构

研究发现仅需20%的天然序列即可支持菌株存活，约45%的天然序列足以恢复菌株的稳健表型；并进而利用显著区别于天然序列的合成型序列构建了可替代内源chrXIIL来支持酵母存活的功能性人工染色体。作为包含了物种所有遗传信息的复杂序列，基因组存在普遍的冗余性。除了维持生存所需的必需基因外，基因组内还具有大量辅助型核心基因，使得生命系统在面对复杂环境变化或者部分基因功能丧失时依旧能维持正常运转。合成基因组学作为新兴的研究领域，以突破从头设计与合成物种基因组的相关...
12-052023

Cell & Bioscience︱深圳先进院揭示mTOR信号在着床前胚胎谱系分化中功能作用

该研究揭示了mTOR在8细胞到囊胚转变过程中起关键作用并保障早期胚胎发育的质量。代谢稳态与细胞命运决定和胚胎早期受损发展密切相关。蛋白激酶雷帕霉素靶蛋白(mTOR)是细胞代谢的关键调节因子在身体里。抑制早期胚胎mTOR信号导致胚胎植入后发育失败，并探讨其机制仍然知之甚少。近日，中国科学院深圳先进技术研究院医药所能量代谢与生殖研究中心雷晓华课题组在Cell & Bi...
12-012023

Nature Chemical Biology | 新型“活材料”设计的“IT+BT”新范式

该工作通过联合生物信息学、结构生物学和合成生物学的技术方法，实现了对合成特定生物聚合物菌株的高通量挖掘和筛选、生物聚合物组装机制的解析以及新型“活材料”的理性设计，搭建出快速开发新型“活材料”的“IT+BT”新范式。11月27日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所钟超课题组、周佳海课题组与深圳未知君谭验团队合作在Nature Chemical Biology上发表设计新型“活材料”的“IT+BT”新范式，题为Accelerating the design of pili-enabled living materials using an integrative technological w...

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