科研进展--中国科学院深圳先进技术研究院

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科研进展

01-042023

Biomaterials | 超声分子成像p32蛋白的细胞膜易位可预测肿瘤的恶性进展

该工作提供了一种实现p32蛋白易位的超声分子成像并以此评估肿瘤转移的新方法。p32蛋白是一种重要的肿瘤分子标志物，其在细胞膜上的分布水平是肿瘤细胞恶性转变的一个重要特征，随着肿瘤细胞恶性程度的增加，p32蛋白在细胞表面的表达水平会逐渐增高，可作为肿瘤恶性进展的分子标志物。受这一现象的启发，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所严飞研究员团队...
01-032023

Nature Communications | 深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒

该工作首次对来自人类肠道宏基因组的古菌病毒进行了深入挖掘及全面分析，揭示了人类肠道中古菌病毒组的多样性，为人类肠道古菌病毒组的研究提供了前所未有的一瞥。北京时间12月30日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在国际学术期刊《自然-通讯》（nature communications，IF=17.69）上发表了题为"Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in the human gut"的文章。该工作首次对来自人类肠道宏...
01-032023

eLife | lncRNA HOTAIR小鼠模型解析其促进乳腺癌细胞转移的机制

该研究首次建立了可诱导过表达人类长非编码RNA HOTAIR的小鼠模型。北京时间12月29日，中科院深圳先进院马晴研究员课题组与斯坦福大学Howard Chang实验室、上海交通大学李令杰课题组合作，在国际学术期刊eLife上发表了题为“Inducible lncRNA transgenic mice reveal continual role of HOTAIR in promoting breast cancer metastasis”的研究论文。该研究...
12-302022

Materials Today Bio | 微流控芯片技术助力细胞外囊泡产量提高

研发了一种微流控芯片技术，实现了细胞的工程化改造，并显著提高了细胞外囊泡的分泌量。近日，中国科学院深圳先进技术研究院杨慧课题组研发了一种微流控芯片技术，实现了细胞的工程化改造，并显著提高了细胞外囊泡的分泌量。最新研究成果以“Mechanical stimulation on a microfluidic device to highly enhance small extracellular vesicle secretion of mesenchymal st...
12-292022

Sensors and Actuators B:Chemical | 基于震荡电场诱导电喷流技术的荧光水凝胶微球通用合成方法

报道了一种基于震荡电场诱导电喷流技术的荧光水凝胶微球通用合成方法，应用于微流芯片中，快速且高通量的合成多种均一度极佳的高性能荧光水凝胶微球。　　近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所的门涌帆副研究员团队和陈艳研究员团队，在国际学术期刊Sensors and Actuators B:Chemical（IF=9.221）上发表了题为“Facile and scalable generation of fluorescent microspheres using a microfluidic electrojetting device”的文章，报...
12-272022

Briefings in Bioinformatics | 人工智能算法指导实验机器人进行蛋白质工程改造

本研究依托深圳合成生物研究重大科技基础设施，开发了一种自动化蛋白质工程方法BO-EVO，通过多轮机器学习与机器实验迭代，大幅提升了蛋白质多位点组合突变设计空间的探索效率，能够以<1%湿实验量寻找获得全局最优实验结果。北京时间12月24日，中国科学院深圳先进技术研究院司同课题组和乔宇课题组合作，在生物信息期刊Briefings in Bioinformatics (IF: 13.994) 在线发表研究论文 “Protein engineering via Bayesian optimization-guided evolutionary algorithm and robotic experiments” 。本研究依托深...
12-272022

ACS Energy Letters ｜眼见为实：瞬态光谱观察光生电子在金纳米颗粒-蓝细菌杂合体的界面传递

为解析电子在材料-微生物界面传递机制提供基础。光能易获取、能量充足，是公认的未来人类最安全、最绿色、和最理想的替代能源之一。天然光合作用可以直接利用光能固定空气中的CO2合成有机物，但光合作用的效率较低（通常低于1%）。近年来发展的半导体材料-微生物人工杂合体系，同时结合了高效捕获光能的半导体材料和高特异性催化的微生...
12-272022

Microbiology Spectrum | 检测转录因子结合位点的新方法

该研究发展了一种检测转录因子结合位点的新方法，通过诱导转录因子-胞嘧啶脱氨酶融合蛋白表达、高通量测序和单核苷酸多态性（SNP）分析，获得转录因子的全基因组结合位点信息。 12月19日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所金帆课题组在国际学术期刊Microbiology Spectrum上发表了题为《AIDmut-Seq: A three-step method for detecting protein-DNA binding specificity》的研究成果。该研究发展了一种检测转录因子结合位点（transcription factor b...
01-032023

J Neurosci︱果蝇椭球体环状神经元亚型在睡眠调控中的特异性作用

文章鉴定出果蝇中央脑椭球体中几类环状神经元亚型以协同方式影响睡眠的稳态和结构，有助于揭示大脑中编码和整合的规则。睡眠在许多生理功能中发挥关键作用，而大脑中的睡眠调控是个十分复杂的过程，从分子、细胞、环路及网络水平层次上进行调控[1-5]。与哺乳动物相比，果蝇作为研究睡眠的模型具有脊椎动物睡眠的大多数高度保守特征，且中枢神经小巧，具备强大的遗传工具。果蝇大脑的椭球体（ellipsoid body，...
12-142022

Nucleic Acids Research ｜底盘噬菌体的高通量制备

该工作报道了一种高通量制备底盘噬菌体的方法，在鉴定噬菌体非必需基因的同时，获得底盘噬菌体，并得到比野生型噬菌体侵染能力更强的基因组简化噬菌体，在噬菌体治疗和噬菌体合成生物学中具有巨大的潜在价值。北京时间12月14日，中国科学院深圳先进技术研究院马迎飞团队在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research，IF=19））上发表了题为Genome-scale top-down strategy to generate viable genome-reduced phages的文章。该工作报道了一种高通量制备底盘噬菌体的方法，在鉴定噬菌体非...

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